Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab11fip1Q9D620 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms