Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc7Q9D541 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms