Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zc2hc1bQ9D534 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zc2hc1bQ9D534 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms