Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PrameQ9D4Z5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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PrameQ9D4Z5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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PrameQ9D4Z5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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