Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lonrf3Q9D4H7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.4 ms