Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms