Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms