Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2K6

D930007J09Rik, RIKEN cDNA D930007J09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D930007J09RikQ9D2K6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D930007J09RikQ9D2K6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms