Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef12Q9D2F1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms