Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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