Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Zbed3Q9D0L1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Zbed3Q9D0L1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms