Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm8Q9CXT6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm8Q9CXT6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm8Q9CXT6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm8Q9CXT6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kdm8Q9CXT6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms