Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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