Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhobtb3Q9CTN4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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