Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1bQ9CSU0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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