Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snw1Q9CSN1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Snw1Q9CSN1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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