Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atp6v0e1Q9CQD8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms