Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpa3Q9CQ71 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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