Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms