Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pole4Q9CQ36 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms