Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim3Q99PE5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim3Q99PE5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms