Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nup155Q99P88 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms