Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rassf3Q99P51 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rassf3Q99P51 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rassf3Q99P51 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rassf3Q99P51 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rassf3Q99P51 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rassf3Q99P51 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rassf3Q99P51 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rassf3Q99P51 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rassf3Q99P51 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms