Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel1Q99MW3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramel1Q99MW3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms