Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrrtQ99MR6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrrtQ99MR6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms