Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr3Q99MB1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms