Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprtQ99M80 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprtQ99M80 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
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