Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gdpd3Q99LY2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms