Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp16Q99LG0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp16Q99LG0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms