Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pagr1aQ99L02 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms