Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ciao1Q99KN2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms