Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn16Q925N4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn16Q925N4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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