Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfdQ925I7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfdQ925I7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfdQ925I7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfdQ925I7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfdQ925I7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfdQ925I7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfdQ925I7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfdQ925I7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfdQ925I7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfdQ925I7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfdQ925I7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfdQ925I7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfdQ925I7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfdQ925I7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfdQ925I7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfdQ925I7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfdQ925I7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfdQ925I7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfdQ925I7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfdQ925I7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfdQ925I7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms