Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms