Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pde6cQ91ZQ1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pde6cQ91ZQ1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms