Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms