Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd3Q91WC0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd3Q91WC0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms