Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms