Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cabp4Q8VHC5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cabp4Q8VHC5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cabp4Q8VHC5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cabp4Q8VHC5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cabp4Q8VHC5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cabp4Q8VHC5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cabp4Q8VHC5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cabp4Q8VHC5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cabp4Q8VHC5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cabp4Q8VHC5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cabp4Q8VHC5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cabp4Q8VHC5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cabp4Q8VHC5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cabp4Q8VHC5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cabp4Q8VHC5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cabp4Q8VHC5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cabp4Q8VHC5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cabp4Q8VHC5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cabp4Q8VHC5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cabp4Q8VHC5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cabp4Q8VHC5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cabp4Q8VHC5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cabp4Q8VHC5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cabp4Q8VHC5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cabp4Q8VHC5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms