Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ttc39cQ8VE09 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ttc39cQ8VE09 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39cQ8VE09 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ttc39cQ8VE09 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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