Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rprd1aQ8VDS4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rprd1aQ8VDS4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rprd1aQ8VDS4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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