Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Uhrf1Q8VDF2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Uhrf1Q8VDF2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Uhrf1Q8VDF2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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