Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ttc8Q8VD72 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ttc8Q8VD72 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ttc8Q8VD72 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ttc8Q8VD72 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ttc8Q8VD72 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ttc8Q8VD72 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ttc8Q8VD72 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ttc8Q8VD72 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ttc8Q8VD72 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ttc8Q8VD72 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ttc8Q8VD72 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc8Q8VD72 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms