Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam20bQ8VCS3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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