Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ApobrQ8VBT6 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApobrQ8VBT6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms