Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r200Q8R281 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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