Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms