Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lin28aQ8K3Y3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lin28aQ8K3Y3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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