Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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