Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrdQ8K2M3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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